Équipes de recherche

Génétique et Génomique Adaptative

AGG 2 membres

Nous recherchons toujours des candidats. Si vous souhaitez travailler avec nous et que vous pensez que vous êtes éligible pour postuler à votre propre financement (par exemple une bourse Marie Curie), veuillez nous contacter.

Postes de doctorants

Bioinformatique et évolution chez la tomate

Nous recherchons des étudiants motivés pour effectuer une analyse de données de séquençage de nouvelle génération afin d'étudier l'évolution de la tomate.
La richesse des jeux de données génomiques sur la tomate et ses parents sauvages a ouvert pour la première fois l'occasion de résoudre une série de questions sur l'évolution de cette importante espèce (Lin et al 2014, Aflitos et al.2014, Tieman et al.2017 et Zhu et al.2018).
Au laboratoire, nous comptons sur l'expertise et les outils pour effectuer la bioinformatique et l'analyse des données. Si vous êtes intéressé à manipuler des ensembles de données massifs pour répondre à des questions évolutives et avez de l'expérience (ou souhaitez apprendre) la programmation informatique et l'analyse de données, veuillez nous contacter.
Une description plus détaillée du projet de doctorat peut être trouvée ici
Envoyez un CV, une lettre de motivation et autant de lettres de référence que possible ici


Postes de Master

Génétique de la tomate

Nous recherchons des étudiants motivés pour travailler dans la génétique et l'évolution de la tomate.
Nos découvertes récentes ont ouvert un certain nombre de projets de Master sur l'évolution des rythmes circadiens et la période de floraison de la tomate. Voir Müller et al. 2018, Soyk et al. 2017 et Müller et al. 2016 dans notre page publications.
Les projets proposés impliquent le phénotypage des plantes, le génotypage, la culture et la transformation in vitro. Les candidats intéressés doivent envoyer un CV, une lettre de motivation et autant de lettres de référence que possible ici

Développeur de logiciels avec des compétences en programmation orientée objet

Nous recherchons un bioinformaticien / développeur expérimenté avec des compétences en programmation orientée objet.
L'une des principales techniques utilisées dans notre laboratoire est les ensembles de données de séquençage de nouvelle génération (ADN et ARN-seq). Nous avons développé un certain nombre de workflows qui utilisent ce type de données pour des tâches qui pourraient intéresser la plupart des laboratoires de biologie, y compris ceux qui ont peu d'expérience en bioinformatique.
Le candidat retenu sera en charge du développement d'un logiciel qui sera mis à la disposition du public avec une publication scientifique. Elle / Il recevra une version de travail de ce logiciel écrite en Perl. Cette version doit être optimisée et traduite en package pour une utilisation générale.
Ce travail donnera au candidat une expérience avec les données de séquençage de nouvelle génération et une opportunité de voir comment l'analyse des données alimente un laboratoire de biologie humide. Le candidat interagira avec tous les membres du laboratoire et assistera à toutes les réunions de laboratoire ainsi qu'aux séminaires scientifiques de l'institut.
L'examen des candidatures commencera immédiatement et restera ouvert jusqu'à ce que le poste soit pourvu.
Les candidats intéressés doivent envoyer un CV, une lettre de motivation et autant de lettres de référence que possible ici
Génétique et Génomique Adaptative

Responsable :

José JIMÉNEZ-GÓMEZ
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