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Benoît ALUNNI Directeur de recherche

Acquisition d'Azote dans les Systèmes Symbiotiques Plantes-Microbes

Benoît Alunni, directeur de recherche à l'INRAE au sein de l'équipe SYNAPS, est un microbiologiste qui étudie l'interaction entre le maïs et son microbiote comme levier pour réduire l'utilisation d'engrais.
Microbiologie, Interactions Plantes-Microorganismes

Mes recherches : Je m'intéresse à l'analyse des interactions plantes-microorganismes et entre microorganismes au sein de la rhizosphère du maïs et dans l'hyphosphère des champignons mycorhiziens arbusculaires. Mes recherches visent à comprendre comment les plants de maïs recrutent leur microbiote dans des conditions d'apport limité en azote et quels services le microbiote rend à son hôte, en mettant particulièrement l'accent sur les flux de nutriments et la signalisation moléculaire entre les partenaires. Pour ce faire, je développe des communautés microbiennes synthétiques (SynCom) et j'analyse les exsudats racinaires/fongiques des plantes afin de déchiffrer le rôle de molécules spécifiques dans le recrutement du microbiote.


Depuis mon arrivée dans l'équipe en 2023, je coordonne :
- un financement INRAE BAP pour analyser le rôle du microbiote de la rhizosphère du maïs dans la nutrition des plantes dans des conditions d'apport limité en azote.
- un financement ANR PRCE (HyphAMaize 2025-2029) avec des collègues du LRSV – Toulouse, Maiage/Migale – Jouy-en-Josas, GetPlaGe – Toulouse et Agronutrition – Labège, pour déchiffrer l'interaction métabolique entre les champignons mycorhiziens arbusculaires et les bactéries associées à l'hysphosphère
- un financement InterCarnot 3BCar-Plant2Pro avec des collègues de l'IJPB – Versailles et du BBF – Marseille pour étudier l'effet des digestats de biomasse de Miscanthus sur la biostimulation et l'immunité du maïs contre le charbon du maïs 
- un contrat doctoral financé par la Direction générale de l'INRAE pour soutenir le projet ANR HyphAMaize.  

Je suis également partenaire de différents projets :
- programme Agroécologie de l'Université Paris-Saclay de la GS Biosphera sur le microbiote du mucilage des racines aériennes du maïs (Coord. J. Fievet/R. Rincent – GQE Le Moulon)
- un projet Plant2Pro axé sur l'évolution expérimentale de l'holobionte du maïs (Coord. M. Blouin, Agoécologie – Dijon)
- responsable de WP dans le cadre du projet SOYSTAINABLE PIA4 (Coord. JM. Couzigou, LRSV - Toulouse) visant à développer les ressources génétiques du soja et des microbes associés afin de stimuler l'augmentation de la culture du soja en France.
- un projet soutenu par le métaprogramme INRAE Holoflux (Projet HOLPRO, coord. Pascal Piveteau, OPAALE - Rennes) visant à comprendre l'impact des produits résiduaires organiques sur la production végétale et sur la biosécurité des productions (flux de pathogènes humains de la technosphère vers l'agrosphère).


Administration :
-    Coordinateur adjoint de l’École Universitaire de Recherche Saclay Plant Sciences
-    Membre du conseil scientifique de l'INRAE BAP
-    Trésorier et membre du conseil d'administration de la Société française de biologie végétale (SFBV)
-    Membre du conseil scientifique de la Société française de phytopathologie (SFP)


Enseignement (environ 25 h/an) à l'Université Paris-Saclay, dans le cadre du Master en Biologie Agrosciences - Sciences Végétales  


Je co-encadre depuis la rentrée 2025 les travaux doctoraux de Damien Fuster (avec Eoghan King) et Joseph Mangoni-Mpay (avec Alia Dellagi).    

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Mini-CV :
2023-                 Directeur de recherche à l'INRAE
                           Equipe SYNAPS, PI: A. Dellagi
                           IJPB  - Sciences végétales, Versailles

2017                   Habilitation (HDR) – Université Paris-Saclay

2009-2023       Maître de conférences à l'Université Paris Saclay
2012-2023        Différenciation terminale des bactéroïdes dans la symbiose légumineuses-rhizobium
                           Équipe Interaction Plante-Bactérie, PI : P. Mergaert
                           I2BC, Gif-sur-Yvette.  

2009-2012        Réponse du haricot commun aux éliciteurs microbiens
                           Équipe Évolution des gènes NLR du haricot commun, PI : V. Geffroy
                           IBP, Orsay.

2008-2009      Post-doctorat sur la pathogénie bactérienne chez Dickeya
                          dadantii

                          Équipe Régulation de la pathogénie, PI : F. van Gijsegem
                          LPP AgroParisTech, Paris. 

2007-2008     Assistant de recherche et d'enseignement (ATER) 
                          Université Paris Cité, Paris / ISV, Gif-sur-Yvette, PI : M. Crespi/V. Gruber
                          Stress salin dans la symbiose légumineuse-rhizobium

2007                 Doctorat sur la symbiose légumineuse-rhizobium 
                          Equipe Symbiose Rhizpobiium-Légumineuses, PI : E. Kondorosi/P. Mergaert
                          ISV, Gif-sur-Yvette. 
                          Différenciation cellulaire des bactéroïdes dans la symbiose légumineuse-rhizobium.   

Benoît Alunni

Contacts

Acquisition d'Azote dans les Systèmes Symbiotiques Plantes-Microbes


Email : benoit.alunni@inrae.fr
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