Benoît Alunni, directeur de recherche à l'INRAE au sein de l'équipe SYNAPS, est un microbiologiste qui étudie l'interaction entre le maïs et son microbiote comme levier pour réduire l'utilisation d'engrais.
Mes recherches : Je m'intéresse à l'analyse des interactions plantes-microorganismes et entre microorganismes au sein de la rhizosphère du maïs et dans l'hyphosphère des champignons mycorhiziens arbusculaires. Mes recherches visent à comprendre comment les plants de maïs recrutent leur microbiote dans des conditions d'apport limité en azote et quels services le microbiote rend à son hôte, en mettant particulièrement l'accent sur les flux de nutriments et la signalisation moléculaire entre les partenaires. Pour ce faire, je développe des communautés microbiennes synthétiques (SynCom) et j'analyse les exsudats racinaires/fongiques des plantes afin de déchiffrer le rôle de molécules spécifiques dans le recrutement du microbiote.
Depuis mon arrivée dans l'équipe en 2023, je coordonne :
- un financement INRAE BAP pour analyser le rôle du microbiote de la rhizosphère du maïs dans la nutrition des plantes dans des conditions d'apport limité en azote.
- un financement ANR PRCE (HyphAMaize 2025-2029) avec des collègues du LRSV – Toulouse, Maiage/Migale – Jouy-en-Josas, GetPlaGe – Toulouse et Agronutrition – Labège, pour déchiffrer l'interaction métabolique entre les champignons mycorhiziens arbusculaires et les bactéries associées à l'hysphosphère
- un financement InterCarnot 3BCar-Plant2Pro avec des collègues de l'IJPB – Versailles et du BBF – Marseille pour étudier l'effet des digestats de biomasse de Miscanthus sur la biostimulation et l'immunité du maïs contre le charbon du maïs
- un contrat doctoral financé par la Direction générale de l'INRAE pour soutenir le projet ANR HyphAMaize.
Je suis également partenaire de différents projets :
- programme Agroécologie de l'Université Paris-Saclay de la GS Biosphera sur le microbiote du mucilage des racines aériennes du maïs (Coord. J. Fievet/R. Rincent – GQE Le Moulon)
- un projet Plant2Pro axé sur l'évolution expérimentale de l'holobionte du maïs (Coord. M. Blouin, Agoécologie – Dijon)
- responsable de WP dans le cadre du projet SOYSTAINABLE PIA4 (Coord. JM. Couzigou, LRSV - Toulouse) visant à développer les ressources génétiques du soja et des microbes associés afin de stimuler l'augmentation de la culture du soja en France.
- un projet soutenu par le métaprogramme INRAE Holoflux (Projet HOLPRO, coord. Pascal Piveteau, OPAALE - Rennes) visant à comprendre l'impact des produits résiduaires organiques sur la production végétale et sur la biosécurité des productions (flux de pathogènes humains de la technosphère vers l'agrosphère).
Administration :
- Coordinateur adjoint de l’École Universitaire de Recherche Saclay Plant Sciences
- Membre du conseil scientifique de l'INRAE BAP
- Trésorier et membre du conseil d'administration de la Société française de biologie végétale (SFBV)
- Membre du conseil scientifique de la Société française de phytopathologie (SFP)
Enseignement (environ 25 h/an) à l'Université Paris-Saclay, dans le cadre du Master en Biologie Agrosciences - Sciences Végétales
Je co-encadre depuis la rentrée 2025 les travaux doctoraux de Damien Fuster (avec Eoghan King) et Joseph Mangoni-Mpay (avec Alia Dellagi).
Google Scholar page - LinkedIn page
Mini-CV :Depuis mon arrivée dans l'équipe en 2023, je coordonne :
- un financement INRAE BAP pour analyser le rôle du microbiote de la rhizosphère du maïs dans la nutrition des plantes dans des conditions d'apport limité en azote.
- un financement ANR PRCE (HyphAMaize 2025-2029) avec des collègues du LRSV – Toulouse, Maiage/Migale – Jouy-en-Josas, GetPlaGe – Toulouse et Agronutrition – Labège, pour déchiffrer l'interaction métabolique entre les champignons mycorhiziens arbusculaires et les bactéries associées à l'hysphosphère
- un financement InterCarnot 3BCar-Plant2Pro avec des collègues de l'IJPB – Versailles et du BBF – Marseille pour étudier l'effet des digestats de biomasse de Miscanthus sur la biostimulation et l'immunité du maïs contre le charbon du maïs
- un contrat doctoral financé par la Direction générale de l'INRAE pour soutenir le projet ANR HyphAMaize.
Je suis également partenaire de différents projets :
- programme Agroécologie de l'Université Paris-Saclay de la GS Biosphera sur le microbiote du mucilage des racines aériennes du maïs (Coord. J. Fievet/R. Rincent – GQE Le Moulon)
- un projet Plant2Pro axé sur l'évolution expérimentale de l'holobionte du maïs (Coord. M. Blouin, Agoécologie – Dijon)
- responsable de WP dans le cadre du projet SOYSTAINABLE PIA4 (Coord. JM. Couzigou, LRSV - Toulouse) visant à développer les ressources génétiques du soja et des microbes associés afin de stimuler l'augmentation de la culture du soja en France.
- un projet soutenu par le métaprogramme INRAE Holoflux (Projet HOLPRO, coord. Pascal Piveteau, OPAALE - Rennes) visant à comprendre l'impact des produits résiduaires organiques sur la production végétale et sur la biosécurité des productions (flux de pathogènes humains de la technosphère vers l'agrosphère).
Administration :
- Coordinateur adjoint de l’École Universitaire de Recherche Saclay Plant Sciences
- Membre du conseil scientifique de l'INRAE BAP
- Trésorier et membre du conseil d'administration de la Société française de biologie végétale (SFBV)
- Membre du conseil scientifique de la Société française de phytopathologie (SFP)
Enseignement (environ 25 h/an) à l'Université Paris-Saclay, dans le cadre du Master en Biologie Agrosciences - Sciences Végétales
Je co-encadre depuis la rentrée 2025 les travaux doctoraux de Damien Fuster (avec Eoghan King) et Joseph Mangoni-Mpay (avec Alia Dellagi).
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2023- Directeur de recherche à l'INRAE
Equipe SYNAPS, PI: A. Dellagi
IJPB - Sciences végétales, Versailles
2017 Habilitation (HDR) – Université Paris-Saclay
2009-2023 Maître de conférences à l'Université Paris Saclay
2012-2023 Différenciation terminale des bactéroïdes dans la symbiose légumineuses-rhizobium
Équipe Interaction Plante-Bactérie, PI : P. Mergaert
I2BC, Gif-sur-Yvette.
2009-2012 Réponse du haricot commun aux éliciteurs microbiens
Équipe Évolution des gènes NLR du haricot commun, PI : V. Geffroy
IBP, Orsay.
2008-2009 Post-doctorat sur la pathogénie bactérienne chez Dickeya
dadantii
Équipe Régulation de la pathogénie, PI : F. van Gijsegem
LPP AgroParisTech, Paris.
2007-2008 Assistant de recherche et d'enseignement (ATER)
Université Paris Cité, Paris / ISV, Gif-sur-Yvette, PI : M. Crespi/V. Gruber
Stress salin dans la symbiose légumineuse-rhizobium
2007 Doctorat sur la symbiose légumineuse-rhizobium
Equipe Symbiose Rhizpobiium-Légumineuses, PI : E. Kondorosi/P. Mergaert
ISV, Gif-sur-Yvette.
Différenciation cellulaire des bactéroïdes dans la symbiose légumineuse-rhizobium.
Contacts
Acquisition d'Azote dans les Systèmes Symbiotiques Plantes-MicrobesEmail : benoit.alunni@inrae.fr