L’Observatoire du Végétal (OV) est un cluster important et unique de plateformes intégrées dédiées au phénotypage multi-niveaux des plantes.
Les compétences de l'OV couvrent une large gamme de technologies et d’analyses : de la culture et du phénotypage des plantes à leur caractérisation biochimique, chimique, métabolique et visuelle. Elle comprend également le Centre de Ressources Biologiques (CRB) Arabidopsis Versailles (VASC) qui met à disposition des utilisateurs un nombre très élevé d’accessions naturelles et de lignées mutantes ou recombinantes (RILs). Le personnel de la plateforme possède un vaste portefeuille de savoir-faire et d’expertises qui inclut la préparation des échantillons et l’analyse des données.
Question biologique
L‘Observatoire du Végétal (OV) se décline en plusieurs composantes :
OV-Culture de Plantes et Phenoscope:
> culture et production de plantes et tissus végétaux dans des conditions contrôlées en serre, chambres de culture, quarantaine ou niveau de biosécurité S3. Infection par des pathogènes végétaux.
> phénotypage automatisé (4 robots de phénotypage à haut débit pour Arabidopsis permettant une imagerie macroscopique visible, IR ou multispectrale ; un robot de phénotypage 'XL' pour plantes de taille moyenne ou post-floraison comme Arabidopsis jusqu'à graines).
OV-CRB Arabidopsis Versailles:
> propagation, stockage et distribution de matériel génétique (50 000 mutants d’insertion, plusieurs milliers de lignées recombinantes d’Arabidopsis et d’accessions).
OV-Analyses (Cytologie /Imagerie; Chimie /Métabolisme ; Biochimie) :
> étude des protéines et de leurs assemblages (expression hétérologue, purification, caractérisation fonctionnelle et structurale, ), interactions protéine / protéine ou protéine / ligand
> imagerie végétale: microscopie confocale et visible, microscopie électronique à balayage, hybridation in situ, microscopie à dissection laser, cytométrie en flux, localisation subcellulaire et immunolocalisation dynamique (microscopie à disque tournant) et FISH.
> profilage des métabolites: analyse des métabolites primaires (acides aminés et sucres) et secondaires (parois cellulaires, flavonoïdes, etc.) par GC-MS, GC-QTOF, MALDI-TOF, LC-MS / MS, quantification des lipides et des hormones végétales par uHPLC-MS / MS, marquage isotopique et analyse isotopique (analyse élémentaire et IR-MS), analyse in situ (spectroscopie infrarouge FT-IR et NIRS).
Enjeux économiques et sociétaux
L’Observatoire du Végétal accueille de nombreux projets et demandes de prestations émanant de partenaires privés.
Nous avons mis en place un point d'accès commun pour toutes les plateformes (https://www.observatoire-vegetal.inra.fr) à destination des utilisateurs industriels et académiques. Un calcul complet des coûts sera initié et appliqué avec nos listes de prix.
Les lignées du CRB Arabidopsis Versailles sont disponibles sur ce lien.
Question biologique
L‘Observatoire du Végétal (OV) se décline en plusieurs composantes :
OV-Culture de Plantes et Phenoscope:
> culture et production de plantes et tissus végétaux dans des conditions contrôlées en serre, chambres de culture, quarantaine ou niveau de biosécurité S3. Infection par des pathogènes végétaux.
> phénotypage automatisé (4 robots de phénotypage à haut débit pour Arabidopsis permettant une imagerie macroscopique visible, IR ou multispectrale ; un robot de phénotypage 'XL' pour plantes de taille moyenne ou post-floraison comme Arabidopsis jusqu'à graines).
OV-CRB Arabidopsis Versailles:
> propagation, stockage et distribution de matériel génétique (50 000 mutants d’insertion, plusieurs milliers de lignées recombinantes d’Arabidopsis et d’accessions).
OV-Analyses (Cytologie /Imagerie; Chimie /Métabolisme ; Biochimie) :
> étude des protéines et de leurs assemblages (expression hétérologue, purification, caractérisation fonctionnelle et structurale, ), interactions protéine / protéine ou protéine / ligand
> imagerie végétale: microscopie confocale et visible, microscopie électronique à balayage, hybridation in situ, microscopie à dissection laser, cytométrie en flux, localisation subcellulaire et immunolocalisation dynamique (microscopie à disque tournant) et FISH.
> profilage des métabolites: analyse des métabolites primaires (acides aminés et sucres) et secondaires (parois cellulaires, flavonoïdes, etc.) par GC-MS, GC-QTOF, MALDI-TOF, LC-MS / MS, quantification des lipides et des hormones végétales par uHPLC-MS / MS, marquage isotopique et analyse isotopique (analyse élémentaire et IR-MS), analyse in situ (spectroscopie infrarouge FT-IR et NIRS).
Enjeux économiques et sociétaux
L’Observatoire du Végétal accueille de nombreux projets et demandes de prestations émanant de partenaires privés.
Nous avons mis en place un point d'accès commun pour toutes les plateformes (https://www.observatoire-vegetal.inra.fr) à destination des utilisateurs industriels et académiques. Un calcul complet des coûts sera initié et appliqué avec nos listes de prix.
Les lignées du CRB Arabidopsis Versailles sont disponibles sur ce lien.
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