Séminaire Dr Andreas Niebel
Le facteur de transcription NF-YA1 régule le développement des nodules au cours de la symbiose légumineuse-rhizobium[1,2,3,4]. Il a en outre été démontré que les facteurs de transcription NF-Y, qui se lient spécifiquement aux séquences CCAAT dans les promoteurs, agissent comme des facteurs de transcription pionniers tant chez les animaux que chez les plantes[5,6]. Notre hypothèse de travail est que NF-YA1 agit également comme un facteur de transcription pionnier chez Medicago truncatula, régulant la transition de la racine vers le nodule. Ces dernières années, les ARN longs non codants (ARNlnc) ont été décrits comme une nouvelle classe de régulateurs jouant un rôle dans un large éventail de mécanismes de régulation cellulaire, y compris le contrôle de l'expression génique via des modifications de la chromatine[7]. Des études de transcriptomique comparative ont révélé de nombreux facteurs de transcription (FT) dépendants de NF-YA1 et plusieurs ARNlnc activés au cours des premières étapes de la symbiose légumineuse-rhizobium. Chez les animaux, NF-Y interagit avec l’ARNlnc PANDA. À l'aide d'une stratégie d'immunoprécipitation d'ARN (RIP), nous avons identifié des homologues fonctionnels de PANDA chez arabidopsis et medicago qui interagissent physiquement avec NF-YA1. Il est intéressant de noter que les nodules surexprimant les ARNlnc MtBAMBOOs, AtBAMBOO et HsPANDA présentent des nodules multilobés. Cela indique une activité conservée entre différents règnes des ARNlnc interagissant avec NF-YA1 dans l'établissement du méristème nodulaire. Par conséquent, les ARNlnc interagissant avec ou régulés par NF-YA1 pourraient contribuer à réguler l'expression génique et à consolider l'activité pionnière de ces FT dans le contexte du développement des nodules. Des études fonctionnelles et d'expression suggérant un rôle de ces ARNlnc et FT dans la symbiose entre medicago et les rhizobiums seront présentées.
Reférences
1. Laloum T, De Mita S, Gamas P, Baudin M, Niebel A. 2013. CCAAT-box binding transcription factors in plants: Y so many?. Trends in Plant Science 18:157–16, doi
2. Baudin M, Laloum T, Lepage A, Ripodas C, Ariel F, Frances L, Crespi M, Gamas P, Blanco FA, Zanetti ME et al. 2015. A phylogenetically conserved group of Nuclear Factor-Y transcription factors interact to control nodulation in legumes. Plant Physiology 169: 2761–2773, doi
3. Shrestha, A.; Zhong, S. H.; Therrien, J.; Huebert, T. et al. Lotus japonicus Nuclear Factor YA1, a nodule emergence stage-specific regulator of auxin signalling. New Phytologist, 229, n. 3, p. 1535-1552, Feb 2021, doi
4. Xiao TT, Schilderink S, Moling S, Deinum EE, Kondorosi E, Franssen H, Kulikova O, Niebel A, Bisseling T. 2014. Fate map of Medicago truncatula root nodules. Development 141: 3517–3528, doi
5. Tao Z, Shen L, Gu X, Wang Y and He Y. 2017. Embryonic epigenetic reprogramming by a pioneer transcription factor in plants. Nature. 2017 551(7678):124-128, doi
6. Olfield AJ. et al. Nature Comm 2019. NF-Y controls fidelity of transcription initiation at gene promoters through maintenance of the nucleosome-depleted region, doi
7. Fonouni-Farde, C., Ariel,F., Crespi M. (2021) Plant long noncoding RNAs: New players in the field of post-transcriptional regulations. Non-coding RNA 7 (12), 1-17, doi
Séminaire en anglais
Andreas Niebel, "Infection endosymbiotique et développement nodulaire" ENOD, "Laboratoire des inetractions plantes-microbes-environnement" LIPM, Toulouse
Invitation : Andana Barrios, équipe "Epigénétique et petits ARNs" epiARN
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