Séminaire Pr Ian Small
Conception et test d'enzymes synthétiques d'édition de l’ARN basés sur les protéines PPR des plantes - Vendredi 28 mars 14h00, INRAE, Versailles
L’édition de l’ARN dans les organites des plantes implique des transitions pyrimidiques abondantes, soit de C en U (chez presque toutes les plantes terrestres), soit de U en C (uniquement chez certaines anthocérotes, lycophytes et fougères). Ces deux types d’événements d’édition de l’ARN sont catalysés par des protéines à répétitions pentatricopeptides (PPR) liant l’ARN, dotées d’un domaine C-terminal de cytidine désaminase ou d’uridine aminase. Chez les anthocérotes, les lycophytes et les fougères, l’édition C→U et U→C est fréquemment utilisée pour contrôler la traduction des ARNm (par la création d’un codon de départ ou la suppression d’un codon stop, respectivement) dans les mitochondries et les chloroplastes.
Nous souhaitons reproduire ce mécanisme original de régulation à des fins biotechnologiques dans les organites des plantes. Pour cela, nous développons des enzymes synthétiques d’édition de l’ARN inspirées des protéines naturelles, que l’on peut, en principe, concevoir pour reconnaître n’importe quel ARN cible. Notre design préféré utilise des motifs PPR de type S basés sur des séquences de lycophytes afin d’éviter la dépendance à d’autres cofacteurs observée chez les facteurs d’édition des angiospermes.
Nous avons développé GRASP (Golden Gate Repeat Assembly for Synthetic PPRs), un kit en plaque à haut débit permettant l’assemblage efficace d’enzymes d’édition, ainsi que des tests d’expression protéique sans cellule également à haut débit pour les évaluer. Les enzymes PPR synthétiques d’édition de l’ARN montrent un fort potentiel en tant qu’outils moléculaires applicables à grande échelle pour l’édition ciblée des ARNm.
Séminaire en anglais
Ian Small, ARC Centre of Excellence in Plants for Space, School of Molecular Sciences, The University of Western Australia, Perth, Australia
Invitation : Hakim Mireau, équipe ”Organite et Reproduction” OrgaRepro
En relation avec une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal.
Nous souhaitons reproduire ce mécanisme original de régulation à des fins biotechnologiques dans les organites des plantes. Pour cela, nous développons des enzymes synthétiques d’édition de l’ARN inspirées des protéines naturelles, que l’on peut, en principe, concevoir pour reconnaître n’importe quel ARN cible. Notre design préféré utilise des motifs PPR de type S basés sur des séquences de lycophytes afin d’éviter la dépendance à d’autres cofacteurs observée chez les facteurs d’édition des angiospermes.
Nous avons développé GRASP (Golden Gate Repeat Assembly for Synthetic PPRs), un kit en plaque à haut débit permettant l’assemblage efficace d’enzymes d’édition, ainsi que des tests d’expression protéique sans cellule également à haut débit pour les évaluer. Les enzymes PPR synthétiques d’édition de l’ARN montrent un fort potentiel en tant qu’outils moléculaires applicables à grande échelle pour l’édition ciblée des ARNm.
Séminaire en anglais
Ian Small, ARC Centre of Excellence in Plants for Space, School of Molecular Sciences, The University of Western Australia, Perth, Australia
Invitation : Hakim Mireau, équipe ”Organite et Reproduction” OrgaRepro
En relation avec une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal.
Retour
