Contribution de la variabilité épigénétique dans la plasticité phénotypique
L’épigénétique est le domaine de recherche qui étudie les mécanismes moléculaires, tels que la méthylation de l’ADN, qui orchestrent la manière dont les gènes sont exprimés. Cette surcouche d’information, réversible et transmissible au cours du développement et parfois entre générations, est sous influence de l’environnement et peut ainsi altérer le phénotype des animaux et des végétaux de manière dynamique et durable. Dans ce contexte, j'étudie comment les mécanismes épigénétiques permettent d’adapter le phénotype des individus à leur environnement en développant des approches de programmation des phénotypes (par exemple via des stimulations thermiques précoces).
J'ai rejoint l'IJPB en 2025 pour explorer la contribution de la variabilité épigénétique interindividuelle dans la réponse environnementale. En effet, une forte variabilité interindividuelle du niveau de méthylation de l’ADN a été observée dans une fraction du génome, et celle-ci pourrait contribuer à la plasticité phénotypique. Afin d'étudier l’existence et la fonction des régions épivariables chez les végétaux, je développe des approches multi-omiques (méthylome ONT, transcriptome, Hi-C...) sur les modèles tomate et Arabidopsis en relation avec divers stimulus abiotiques appliqués lors du développement précoce.
L’objectif finalisé de ces travaux est d'identifier des épivariations susceptibles de favoriser l’adaptation des plantes à leur milieu, permettant le développement de stratégies de programmation des phénotypes qui prennent en compte les propriétés épigénétiques propres à chaque génotype, favorisant l’adéquation entre variétés et pratiques culturales dans un contexte de changement climatique.
Lien vers le CV-hal (liste des publications)
Short bio:
2025 - présent: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78).
2021 - 2025: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), UMR Nutrition, Métabolisme, Aquaculture (NuMéA), Aquapôle de Saint-Pée-sur-Nivelle (64). Nutrition et épigénome chez la truite arc-en-ciel.
2012 - 2021: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), UMR Biologie des Oiseaux et Aviculture, INRAE Nouzilly (37). Epigénétique et plasticité métabolique chez l'oiseau.
2010 - 2012: Post-doctorant, Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78). Epigénétique et variabilité naturelle chez Arabidopsis.
2006 - 2010: Post-doctorant, John Innes Centre, Norwich, Royaume-Uni. Linking molecular biology and natural variation to gain insights into Arabidopsis adaptation.
2002 - 2006: Doctorant, École Normale Supérieure, LBMC (Lyon, 69). Étude fonctionnelle de la protéine Heterochromatin Protein 1 au cours du développement post-embryonnaire chez C. elegans.
J'ai rejoint l'IJPB en 2025 pour explorer la contribution de la variabilité épigénétique interindividuelle dans la réponse environnementale. En effet, une forte variabilité interindividuelle du niveau de méthylation de l’ADN a été observée dans une fraction du génome, et celle-ci pourrait contribuer à la plasticité phénotypique. Afin d'étudier l’existence et la fonction des régions épivariables chez les végétaux, je développe des approches multi-omiques (méthylome ONT, transcriptome, Hi-C...) sur les modèles tomate et Arabidopsis en relation avec divers stimulus abiotiques appliqués lors du développement précoce.
L’objectif finalisé de ces travaux est d'identifier des épivariations susceptibles de favoriser l’adaptation des plantes à leur milieu, permettant le développement de stratégies de programmation des phénotypes qui prennent en compte les propriétés épigénétiques propres à chaque génotype, favorisant l’adéquation entre variétés et pratiques culturales dans un contexte de changement climatique.
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Short bio:
2025 - présent: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78).
2021 - 2025: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), UMR Nutrition, Métabolisme, Aquaculture (NuMéA), Aquapôle de Saint-Pée-sur-Nivelle (64). Nutrition et épigénome chez la truite arc-en-ciel.
2012 - 2021: Chargé de Recherche INRAE (CRCN), UMR Biologie des Oiseaux et Aviculture, INRAE Nouzilly (37). Epigénétique et plasticité métabolique chez l'oiseau.
2010 - 2012: Post-doctorant, Institut Jean-Pierre Bourgin, Versailles (78). Epigénétique et variabilité naturelle chez Arabidopsis.
2006 - 2010: Post-doctorant, John Innes Centre, Norwich, Royaume-Uni. Linking molecular biology and natural variation to gain insights into Arabidopsis adaptation.
2002 - 2006: Doctorant, École Normale Supérieure, LBMC (Lyon, 69). Étude fonctionnelle de la protéine Heterochromatin Protein 1 au cours du développement post-embryonnaire chez C. elegans.
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