Faits marquants IJPB des Sciences de la Vie de l'Université Paris-Saclay
Les trois dernières actualités
Un nouvel inhibiteur de la synthèse de la cellulose qui affecte la sécrétion des complexes cellulose-synthase et la dynamique des microtubules, 8/10/24
Dans une étude publiée dans Plant Physiology, les scientifiques de l’équipe “Glycanes et Signalisation” GAS ont découvert un nouvel inhibiteur de la biosynthèse de la cellulose (CBI) le P4B (2-phényl-1-[4-(6-(piperidin-1-yl)pyridazin-3-yl)piperazin-1-yl)butan-1-one), à l’aide un crible chimique afin d’identifier des molécules capables d’inhiber la croissance d’Arabidopsis thaliana. Ils ont également isolé le mutant cesa3pbr1, affecté dans le gène codant la sous-unité catalytique de la cellulose synthétase CESA3 et partiellement résistant au P4B. L’action du P4B est différente de celles des autres CBI. En effet, il pourrait cibler directement CESA3.
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Les modèles de langage pour améliorer la compréhension des mécanismes moléculaires des plantes, 17/9/24
Des scientifiques de l’équipe “Physiologie de la Germination” PHYGERM dans une étude publiée dans Plant Cell Reports, ont exploré l'apport des méthodes d'apprentissage profond, en particulier les grands modèles de langage (LLMs), en biologie végétale. Ces approches permettent des analyses approfondies des séquences d'acides nucléiques et de protéines, facilitant la reconnaissance des structures, fonctions et interactions moléculaires complexes au sein des systèmes végétaux. Cette synthèse met en avant le potentiel des approches basées sur les LLMs pour propulser les recherches en biologie végétale, soutenir la production agricole, et contribuer aux transitions agroécologiques et agroalimentaires durables.
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Admirer en temps réel le ballet des chromosomes durant la méiose, 10/9/24
La reproduction sexuée repose sur alternance de phases où les chromosomes parentaux s’associent (fécondation) puis se séparent (méiose, formation des gamètes). Pour une séparation équilibrée des chromosomes lors de la méiose, il est essentiel que les chromosomes parentaux (homologues) se reconnaissent et s’associent en paires. Toute perturbation de cette association peut entraîner de graves problèmes de stérilité chez les parents ou des anomalies chromosomiques chez la descendance. La manière dont les chromosomes parentaux se reconnaissent dans un espace nucléaire encombré de chromosomes non homologues et s’associent sans provoquer d’enchevêtrements délétères reste un grand mystère. Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques des équipes « Mécanismes de la Méiose » MeioMe et « Modélisation et Imagerie Numérique » MiN ont révélé, pour la première fois chez la plante Arabidopsis thaliana, que les chromosomes sont animés de mouvements extrêmement rapides lors de cette phase de recherche et d’association, comme s’ils étaient secoués violemment dans l’espace nucléaire. Les résultats démontrent la conservation de ces mouvements chromosomiques méiotiques chez les plantes et établissent A. thaliana comme une nouvelle espèce modèle pour leur étude fonctionnelle.
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Dans une étude publiée dans Plant Physiology, les scientifiques de l’équipe “Glycanes et Signalisation” GAS ont découvert un nouvel inhibiteur de la biosynthèse de la cellulose (CBI) le P4B (2-phényl-1-[4-(6-(piperidin-1-yl)pyridazin-3-yl)piperazin-1-yl)butan-1-one), à l’aide un crible chimique afin d’identifier des molécules capables d’inhiber la croissance d’Arabidopsis thaliana. Ils ont également isolé le mutant cesa3pbr1, affecté dans le gène codant la sous-unité catalytique de la cellulose synthétase CESA3 et partiellement résistant au P4B. L’action du P4B est différente de celles des autres CBI. En effet, il pourrait cibler directement CESA3.
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Les modèles de langage pour améliorer la compréhension des mécanismes moléculaires des plantes, 17/9/24
Des scientifiques de l’équipe “Physiologie de la Germination” PHYGERM dans une étude publiée dans Plant Cell Reports, ont exploré l'apport des méthodes d'apprentissage profond, en particulier les grands modèles de langage (LLMs), en biologie végétale. Ces approches permettent des analyses approfondies des séquences d'acides nucléiques et de protéines, facilitant la reconnaissance des structures, fonctions et interactions moléculaires complexes au sein des systèmes végétaux. Cette synthèse met en avant le potentiel des approches basées sur les LLMs pour propulser les recherches en biologie végétale, soutenir la production agricole, et contribuer aux transitions agroécologiques et agroalimentaires durables.
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Admirer en temps réel le ballet des chromosomes durant la méiose, 10/9/24
La reproduction sexuée repose sur alternance de phases où les chromosomes parentaux s’associent (fécondation) puis se séparent (méiose, formation des gamètes). Pour une séparation équilibrée des chromosomes lors de la méiose, il est essentiel que les chromosomes parentaux (homologues) se reconnaissent et s’associent en paires. Toute perturbation de cette association peut entraîner de graves problèmes de stérilité chez les parents ou des anomalies chromosomiques chez la descendance. La manière dont les chromosomes parentaux se reconnaissent dans un espace nucléaire encombré de chromosomes non homologues et s’associent sans provoquer d’enchevêtrements délétères reste un grand mystère. Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques des équipes « Mécanismes de la Méiose » MeioMe et « Modélisation et Imagerie Numérique » MiN ont révélé, pour la première fois chez la plante Arabidopsis thaliana, que les chromosomes sont animés de mouvements extrêmement rapides lors de cette phase de recherche et d’association, comme s’ils étaient secoués violemment dans l’espace nucléaire. Les résultats démontrent la conservation de ces mouvements chromosomiques méiotiques chez les plantes et établissent A. thaliana comme une nouvelle espèce modèle pour leur étude fonctionnelle.
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