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Séminaire Dr Caroline Baroukh

La modélisation métabolique pour mieux comprendre la biologie des phytopathogènes et leurs interactions avec l’hôte - Mardi 12 mai 2026 11h00, INRAE, Versailles

Les agents pathogènes des plantes ont un impact majeur sur la productivité agricole. Il est donc nécessaire d’avoir une meilleure compréhension des mécanismes à l’origine de la pathogénicité. La modélisation métabolique, une approche clé en biologie des systèmes, permet de relier le contenu génomique à la physiologie cellulaire et aux conditions environnementales, en intégrant des données moléculaires dans la reconstruction des réseaux métaboliques et en permettant des prédictions quantitatives de la croissance et des flux métaboliques. Bien que largement utilisée en optimisation des bioprocédés, la modélisation métabolique reste encore sous-exploitée dans l’étude des interactions plante–pathogène. Elle offre pourtant un cadre puissant pour étudier les échanges trophiques au cours de l’infection et pour décrypter les stratégies de virulence des pathogènes. Dans ce séminaire, je présenterai les principes fondamentaux de la modélisation métabolique, puis deux exemples d’application. Le premier concerne la reconstruction du réseau métabolique de Xylella fastidiosa, qui apporte des éléments de compréhension sur sa croissance fastidieuse. Le second porte sur un modèle métabolique de la plante de tomate en interaction avec Ralstonia pseudosolanacearum, un pathogène responsable du flétrissement bactérien chez de nombreuses cultures. Ce modèle reproduit nos données expérimentales et met en évidence des mécanismes biologiques clés impliqués dans le flétrissement bactérien.


Caroline Baroukh, "Pouvoir Pathogène de Ralstonia et adaptation à son environnement" RAP, "Laboratoire des interactions plantes - microbes - environnement" LIPME,  INRAE, Castanet Tolosan
Invitation : Alia Dellagi, équipe "Acquisition d'Azote dans les Systèmes Symbiotiques Plantes-Microbes" SYNAPS


Séminaire relatif à la recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal.


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