Applestorm un projet du PEPR B-Best coordonné par l'IJPB

Présentation du PEPR B-Best
Le programme national de recherche, ou PEPR, B-Best – pour Biomasse, biotechnologies, technologies pour la chimie verte et les énergies renouvelables – est développé de 2023 à 2029 dans le cadre du programme d’investissement gouvernemental France 2030. Doté d’un budget de 70 millions d’euros, il est copiloté par l’IFPEN et l’INRAE. Son objectif est de réunir la communauté scientifique pour construire les fondements des innovations techniques, organisationnelles et sociales qui permettront tout à la fois de comprendre et actionner les leviers d’une transformation efficace de la biomasse pour la production de produits biosourcés et de carburants durables.

Projet Applestorm
Coordinateur : Alexis Peaucelle, équipe "Paroi primaire" PAR
Collaborateurs IJPB : Kalina Haas et Herman Höfte, équipe "Paroi primaire" PAR
Autres collaborateurs : Anne Imberty, CERMAV, Grenoble, Bénédicte Bakan, Marc Lahaye et Richard Sibout, BIA, Nantes

Résumé
Ce projet vise à développer une plateforme d’analyse par imagerie nouvelle génération pour la caractérisation multi-échelle de la biomasse végétale et de ses produits dérivés. Il se concentrera sur les fruits de pomme, de poire et de tomate pour les parois cellulaires primaires et la cuticule, ainsi que sur les tiges de maïs pour les parois cellulaires secondaires. La biomasse sera caractérisée, avant et après extraction, par microscopie corrélative combinant la RAMAN, la microscopie de génération de seconde harmonique multiphotonique, la microscopie à force atomique, l'imagerie multispectrale de la durée de vie de la fluorescence (FLIM) et la microscopie de reconstruction optique stochastique directe (dSTORM) à super-résolution. Pour étendre la résolution de dSTORM à ~15nm et la gamme d'épitopes polymériques détectables, de nouveaux nanoprobes fluorescents spécifiques et à haute affinité seront développés grâce à la biologie synthétique. Les paramètres structuraux multi-échelles peuvent être utilisés pour l'analyse de la variabilité de la biomasse et pour la modélisation des caractéristiques de qualité de la biomasse. La boîte à outils dSTORM étendue sera également utilisée pour cartographier les épitopes sur des molécules de polysaccharides individuelles. Cela pourrait éventuellement conduire à la commercialisation d'équipements pour la caractérisation et le contrôle qualité des polysaccharides. Enfin, la mobilité in situ des enzymes modifiant la paroi cellulaire (pectine-esterases et cellulases) dans différents types de biomasse sera évaluée à l'aide du suivi de particules uniques et corrélée avec les variations des caractéristiques de qualité pertinentes de la biomasse.

Pour en savoir plus sur microscope à super-résolution STORM, actu IJPB 29/11/23


Une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal en collaboration.