Evolution parallèle chez Arabidopsis face au stress salin dans les îles du Cap-Vert
Arabidopsis thaliana
Evolution
Stress salin
Génétique quantitative
Metabolite
Phenoscope
Une découverte des équipes VAST, PO-Pheno, PO-VASC, GAS et PO-Chem
La variabilité naturelle constitue une source infinie de mécanismes adaptatifs. Ceux-ci peuvent être mis en évidence par des approches de génétique quantitative révélant les variants génétiques à l'origine de leur diversité. Combinées à des analyses 'omiques', ces approches permettent d'étudier un large spectre de caractères sans a priori. L'analyse métabolomique non ciblée a précisément l’avantage de détecter un large éventail de métabolites, y compris des composés encore non caractérisés, offrant une fenêtre unique sur des processus biologiques inexplorés. Ces stratégies sont particulièrement pertinentes chez une espèce modèle comme Arabidopsis thaliana.
Une collaboration entre l'IJPB et le CBGP (INIA-CSIC) a permis de développer une telle approche sur des populations sauvages d'Arabidopsis ayant récemment colonisé différentes îles de l'archipel du Cap Vert. Il a été montré qu'une des populations insulaires (île Santo Antao) avait développé la capacité à accumuler un métabolite inconnu, absent des autres populations d'Arabidopsis, et que cette capacité était liée à une mutation inactivant un gène . Grâce à une analyse chimique fine, également guidée par la prédiction de la fonction enzymatique codée par le gène en question (appartenant à une famille de glycoside hydrolases), il a été déterminé que ce métabolite était un disaccharide composé d'acide glucuronique et de mannose.
Étonnamment, la perte de fonction du gène responsable de ce phénotype est apparue indépendamment au moins une seconde fois sur l'île voisine de Fogo, ce qui laisse envisager un phénomène adaptatif sous sélection positive, nommé évolution parallèle. En l'occurrence, les plantes porteuses de cette mutation et accumulant le disaccharide, sont plus tolérantes au stress salin, un facteur environnemental majeur auquel ces populations insulaires doivent faire face.
Le métabolite ainsi identifié et la réponse au stress qui lui est associée, nécessitent des études complémentaires afin d’élucider précisément le mécanisme en cause.
Ces résultats constituent une piste prometteuse pour le développement de variétés mieux adaptées aux conditions environnementales extrêmes chez d'autres espèces d'intérêt, avec un potentiel concret pour l’adaptation au changement climatique.
Une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal en collaboration.
Une collaboration entre l'IJPB et le CBGP (INIA-CSIC) a permis de développer une telle approche sur des populations sauvages d'Arabidopsis ayant récemment colonisé différentes îles de l'archipel du Cap Vert. Il a été montré qu'une des populations insulaires (île Santo Antao) avait développé la capacité à accumuler un métabolite inconnu, absent des autres populations d'Arabidopsis, et que cette capacité était liée à une mutation inactivant un gène . Grâce à une analyse chimique fine, également guidée par la prédiction de la fonction enzymatique codée par le gène en question (appartenant à une famille de glycoside hydrolases), il a été déterminé que ce métabolite était un disaccharide composé d'acide glucuronique et de mannose.
Étonnamment, la perte de fonction du gène responsable de ce phénotype est apparue indépendamment au moins une seconde fois sur l'île voisine de Fogo, ce qui laisse envisager un phénomène adaptatif sous sélection positive, nommé évolution parallèle. En l'occurrence, les plantes porteuses de cette mutation et accumulant le disaccharide, sont plus tolérantes au stress salin, un facteur environnemental majeur auquel ces populations insulaires doivent faire face.
Le métabolite ainsi identifié et la réponse au stress qui lui est associée, nécessitent des études complémentaires afin d’élucider précisément le mécanisme en cause.
Ces résultats constituent une piste prometteuse pour le développement de variétés mieux adaptées aux conditions environnementales extrêmes chez d'autres espèces d'intérêt, avec un potentiel concret pour l’adaptation au changement climatique.
Une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal en collaboration.
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Légende : Plantes d'Arabidopsis sur le robot Phenoscope à l'IJPB, illustrant une grande variabilité naturelle en réponse au stress (O. Loudet, IJPB, INRAE).
Fait marquant IJPB
Contact : Olivier Loudet, contact
Référence
Martínez Rivas FJ, Wozny D, Xue Z, Gilbault E, Sapir T, Rouille M, Ricou A, Medina J, Noël LD, Lauber E, Voxeur A, Mazier M, Loudet O, Clément G, Jiménez-Gómez JM. Parallel evolution of salinity tolerance in Arabidopsis thaliana accessions from Cape Verde Islands. Sci Adv. 2025 Jul 11;11(28):eadq8210. doi: 10.1126/sciadv.adq8210.
Équipes et plateformes IJPB
> Variabilité et Tolérance aux Stress Abiotiques VAST
Équipes collaboratrices
> Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA/CSIC), Pozuelo de Alarcón, Espagne.
> Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Córdoba, Córdoba, Espagne.
> LIPME, Université de Toulouse, INRAE/CNRS, Castanet-Tolosan, France.
> GAFL-Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes, Montfavet, France.
Fait marquant IJPB
Contact : Olivier Loudet, contact
Référence
Martínez Rivas FJ, Wozny D, Xue Z, Gilbault E, Sapir T, Rouille M, Ricou A, Medina J, Noël LD, Lauber E, Voxeur A, Mazier M, Loudet O, Clément G, Jiménez-Gómez JM. Parallel evolution of salinity tolerance in Arabidopsis thaliana accessions from Cape Verde Islands. Sci Adv. 2025 Jul 11;11(28):eadq8210. doi: 10.1126/sciadv.adq8210.
Équipes et plateformes IJPB
> Variabilité et Tolérance aux Stress Abiotiques VAST
> Observatoire du Végétal - Phenoscope PO-Pheno
> Observatoire du Végétal - CRB Arabidopsis Versailles PO-VASC
> Glycanes et Signalisation GAS
> Observatoire du Végétal - Chimie/Métabolisme PO-Chem
Équipes collaboratrices
> Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA/CSIC), Pozuelo de Alarcón, Espagne.
> Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Córdoba, Córdoba, Espagne.
> LIPME, Université de Toulouse, INRAE/CNRS, Castanet-Tolosan, France.
> GAFL-Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes, Montfavet, France.