Offre d'emploi Ingénieur.e d’Étude en Phytopathologie
Contrat de de 24 mois
Un poste de CDD d'Ingénieur d'études en phytopathologie est ouvert au sein de l'équipe "Interactions Azote Pathogènes" NPI, INRAE IJPB à Versailles, France, pour une durée de 24 mois. Le projet sera réalisé en collaboration avec S. Thomine de l’I2BC, CNRS-Gif/Yvette.
Date de prise de poste : 1ᵉʳ Octobre 2024 (date flexible)
Missions
> Caractérisation de la réponse à deux agents pathogènes (P. syringae et B. cinerea) de mutants d’arabidopsis d’homéostasie du fer
> Analyse de données de métabolomique, protéomique et de transcriptomique
Responsabilité
Le/La candidat(e) participera au projet ANR IMUNIRON. Les tâches principales incluent :
1. Sélection, génotypage et phénotypage (pathotests, RT-qPCR et autres réponses de défense) en réponse à l’infection de mutants d’arabidopsis
2. Réalisation, caractérisation et analyse biochimique d’extraits de liquide apoplastique
3. Réalisation d’échantillons en vue d’une analyse protéomique, analyse et exploitation des résultats
4. Contribution à la production de livrables sur l’analyse comparée de données de transcriptome et de métabolome
Le/La candidat(e) devra également
> Produire une synthèse bibliographique sur la sensibilité de mutants d’homéostasie du fer aux agents pathogènes
> Réaliser les analyses statistiques et mettre en forme ses résultats sous forme de figures
> Rédiger des comptes-rendus en anglais.
Compétences attendues
> Diplôme de niveau Master 2 ou équivalent en phytopathologie
> Expertise en phytopathologie et génétique végétale et microbienne
> Compétences en analyse de données, statistiques, et utilisation de R
> Compétences personnelles : forte motivation, curiosité, capacité à travailler en équipe, autonomie
Environnement de travail
L'IJPB développe des recherches dans de nombreux domaines de la biologie végétale L’équipe NPI se focalise sur la caractérisation de l’impact des stress abiotiques sur les
interactions plantes-pathogènes.
Références
> Aznar, A., Chen, N. W. G., Thomine, S. & Dellagi, A. Immunity to plant pathogens and iron homeostasis. Plant Sci. 240, 90–97 (2015).
> Trapet, P. L. et al. Mechanisms underlying iron deficiency-induced resistance against pathogens with different lifestyles. J. Exp. Bot. 72, 2231–2241 (2021).
> Soulie, M. et al. Plant nitrogen supply affects the Botrytis cinerea infection process and modulates known and novel virulence factors. Mol. Plant Pathol. 21, 1436–1450 (2020).
> Sun, X. et al. Pathogen effector recognition-dependent association of NRG1 with EDS1 and SAG101 in TNL receptor immunity. Nat. Commun. 12, 3335 (2021).
> O’Leary, B. M. et al. Early changes in apoplast composition associated with defence and disease in interactions between Phaseolus vulgaris and the halo blight pathogen Pseudomonas syringae Pv. phaseolicola: Leaf apoplast composition during P . syringae infection. Plant Cell Environ. 39, 2172–2184 (2016)
Date de prise de poste : 1ᵉʳ Octobre 2024 (date flexible)
Missions
> Caractérisation de la réponse à deux agents pathogènes (P. syringae et B. cinerea) de mutants d’arabidopsis d’homéostasie du fer
> Analyse de données de métabolomique, protéomique et de transcriptomique
Responsabilité
Le/La candidat(e) participera au projet ANR IMUNIRON. Les tâches principales incluent :
1. Sélection, génotypage et phénotypage (pathotests, RT-qPCR et autres réponses de défense) en réponse à l’infection de mutants d’arabidopsis
2. Réalisation, caractérisation et analyse biochimique d’extraits de liquide apoplastique
3. Réalisation d’échantillons en vue d’une analyse protéomique, analyse et exploitation des résultats
4. Contribution à la production de livrables sur l’analyse comparée de données de transcriptome et de métabolome
Le/La candidat(e) devra également
> Produire une synthèse bibliographique sur la sensibilité de mutants d’homéostasie du fer aux agents pathogènes
> Réaliser les analyses statistiques et mettre en forme ses résultats sous forme de figures
> Rédiger des comptes-rendus en anglais.
Compétences attendues
> Diplôme de niveau Master 2 ou équivalent en phytopathologie
> Expertise en phytopathologie et génétique végétale et microbienne
> Compétences en analyse de données, statistiques, et utilisation de R
> Compétences personnelles : forte motivation, curiosité, capacité à travailler en équipe, autonomie
Environnement de travail
L'IJPB développe des recherches dans de nombreux domaines de la biologie végétale L’équipe NPI se focalise sur la caractérisation de l’impact des stress abiotiques sur les
interactions plantes-pathogènes.
Références
> Aznar, A., Chen, N. W. G., Thomine, S. & Dellagi, A. Immunity to plant pathogens and iron homeostasis. Plant Sci. 240, 90–97 (2015).
> Trapet, P. L. et al. Mechanisms underlying iron deficiency-induced resistance against pathogens with different lifestyles. J. Exp. Bot. 72, 2231–2241 (2021).
> Soulie, M. et al. Plant nitrogen supply affects the Botrytis cinerea infection process and modulates known and novel virulence factors. Mol. Plant Pathol. 21, 1436–1450 (2020).
> Sun, X. et al. Pathogen effector recognition-dependent association of NRG1 with EDS1 and SAG101 in TNL receptor immunity. Nat. Commun. 12, 3335 (2021).
> O’Leary, B. M. et al. Early changes in apoplast composition associated with defence and disease in interactions between Phaseolus vulgaris and the halo blight pathogen Pseudomonas syringae Pv. phaseolicola: Leaf apoplast composition during P . syringae infection. Plant Cell Environ. 39, 2172–2184 (2016)
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Date limite de candidature
15 septembre 2024 (susceptible d’être prolongée)
Date de prise de poste
1ᵉʳ Octobre 2024 (date flexible)
Rémunération
de 2 299 € à 2 461 € brut/mois selon reprise d'ancienneté
Modalités de candidature
Pour postuler, envoyez votre dossier de candidature à Mathilde Fagard, contact,
en joignant :
1. un CV d’une page.