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Nicolas BOUCHÉ Directeur de recherche

Variabilité Naturelle Epigénétique

Bioinformatique

La recherche en épigénétique nécessite de manipuler d'importants jeux de données pour décrire au mieux les paysages épigénomiques des cellules de plantes. La bioinformatique regroupe l'ensemble des outils que nous utilisons pour le faire.

J'anime le groupe de travail SPS bioinformatique depuis 2018. Ce groupe a été créé au sein du réseau SPS (Sciences des Plantes de Saclay) en réponse au besoin croissant en bioanalyse dans notre communauté de chercheurs en biologie végétale. Le groupe est composé d'une vingtaine de bioinformaticiens issus d'équipes de recherche existantes parmi les cinq instituts SPS, dont les rôles sont les suivants : 
  • Établir des objectifs concrets en bioinformatique avec une spécification des besoins délimités en termes de compétences, de temps et de ressources financières​ ;
  • S'assurer que les projets sélectionnés répondent de manière équilibrée aux besoins des différents instituts SPS ;
  • Fédérer la communauté SPS sur les questions de bioanalyses.
Pour atteindre ces objectifs, nous avons mis en place une nouvelle équipe composée de trois ingénieurs bioinformaticiens recrutés par SPS et qui développent des outils destinés aux chercheurs durant des périodes de 6 mois (un appel à projets est lancé deux fois par an). Nous avons également mis en place des animations scientifiques centrées sur ces enjeux, des formations destinées aux chercheurs et aux étudiants de la communauté SPS, ainsi qu'un concours annuel pour attribuer des contrats doctoraux à des étudiants.


Nicolas Bouché

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