BIP (Biological Image Processing): un logiciel orienté pour le traitement d'images par lot, permettant de définir de façon simple des pipelines d'analyse complexes. En savoir plus: (site en construction).
Free-D, un logiciel de reconstruction et de modélisation 3D : ce logiciel est conçu pour la reconstruction et l’analyse quantitative de modèles 3D à partir de piles d’images physiques (histologie) ou virtuelles (eg, microscopie confocale). Il permet de calculer des représentations moyennes et de normaliser des ensembles d’observations entre individus.
En savoir plus : http://free-d.versailles.inra.fr
Free-D, un logiciel de reconstruction et de modélisation 3D : ce logiciel est conçu pour la reconstruction et l’analyse quantitative de modèles 3D à partir de piles d’images physiques (histologie) ou virtuelles (eg, microscopie confocale). Il permet de calculer des représentations moyennes et de normaliser des ensembles d’observations entre individus.
En savoir plus : http://free-d.versailles.inra.fr
MorphoLeaf, un logiciel pour la reconstruction et la quantification de dynamiques morphogénétiques : ce logiciel (plug-in de Free-D) est conçu pour l’estimation et la quantification de l’évolution de la forme d’organes en développement à partir de séries d’observations individuelles.
En savoir plus : http://morpholeaf.versailles.inra.fr
En savoir plus : http://morpholeaf.versailles.inra.fr
Sviewer, un logiciel de visualisation 3D : ce logiciel, conçu comme une version indépendante du module de rendu 3D de Free-D, offre de nombreuses fonctionnalités de visualisation interactive, statique ou dynamique, de structures 3D (ou même 2D).
En savoir plus : http://free-d.versailles.inra.fr
En savoir plus : http://free-d.versailles.inra.fr
MorphoLibJ, un plug-in ImageJ/Fiji pour la morphologie mathématique : une bibliothèque et un ensemble de plug-ins implémentant de nombreux outils de morphologie mathématique pour le traitement et l’analyse des images.
En savoir plus : https://imagej.net/MorphoLibJ
En savoir plus : https://imagej.net/MorphoLibJ
NucleusJ, un plug-in pour l’analyse d’images 3D de noyaux : ce plug-in est conçu pour interfacer notre pipeline de segmentation et d’analyse quantitative d’images de noyaux (cf. Andrey et al 2010).
En savoir plus: https://imagejdocu.tudor.lu/plugin/stacks/nuclear_analysis_plugin/start
En savoir plus: https://imagejdocu.tudor.lu/plugin/stacks/nuclear_analysis_plugin/start
Un plug-in ImageJ/Fiji pour la correction d’atténuation de fluorescence en 3D : ce plug-in est conçu pour corriger l’atténuation de fluorescence en profondeur dans des piles d’images 3D.
En savoir plus https://imagejdocu.tudor.lu/plugin/stacks/attenuation_correction/start
En savoir plus https://imagejdocu.tudor.lu/plugin/stacks/attenuation_correction/start
SerreLab : cette application web est conçue pour la gestion et la suivi des plantes en installations expérimentales et au laboratoire.
En savoir plus : eric.biot@inra.fr
En savoir plus : eric.biot@inra.fr
Responsable :
Philippe Andrey