Six nouveaux projets ANR à l'IJPB

Projet IMOGEN
Modulation inter-organes des réseaux de régulation des gènes chez les plantes : l'exemple des gènes CUP-SHAPED COTYLEDON
Coordinateur : Patrick Laufs, équipe "Facteurs de Transcription et Architecture" FTA
Collaborateurs IJPB : Jean-Christophe Palauqui et Liudmila Chelysheva, équipe "Facteurs de Transcription et Architecture" FTA
Collaborateurs IPS2 : Thomas Blein, Olivier Martin, Olivier Christ, Céline Sorin, Marion Verdenaud, Martin Crespi et Céline Charon 
Résumé
Les facteurs de transcription CUP-SHAPED COTYLEDON (CUC) sont des acteurs clés, conservés au cours de l'évolution, qui dirigent le développement des organes aériens des plantes, dont les rôles dans la racine sont encore inconnus. Le premier objectif de ce projet est de caractériser les rôles des gènes CUC au cours du développement racinaire d'arabidopsis. Le deuxième objectif est d'établir le réseau de régulation génique pour les CUC et de déterminer sa possible modulation par le contexte développemental. Le troisième objectif est de déterminer dans quelle mesure les rôles apparemment diversifiés des gènes CUC dans le développement peuvent en fait cacher un rôle fondamental unique qui n'a pas encore été identifié.

Projet LIPSTIQ
Régulation transcriptionnelle de la biosynthèse de subérine et son rôle dans la qualité des semences en réponse au stress thermique
Coordinateur : Sébastien Baud, équipe "Développement et Qualité de la Graine" SEEDEV
Collaborateurs : Frédéric Domergue et Jérôme Joubès, "Laboratoire de Biogenèse Membranaire" LBM, Université de Bordeaux
Résumé
Dans la graine oléagineuse des Brassicacées, le tégument participe à la nutrition de l’embryon et constitue une barrière protectrice séparant l’embryon de l’environnement extérieur. Le tégument produit un polyester lipidique, appelé subérine, dont les propriétés biophysiques sont particulièrement adaptées à ces différentes fonctions. Le projet LIPSTIQ vise à élucider les voies de biosynthèse de la subérine et la régulation transcriptionnelle de ce métabolisme, notamment dans un contexte de stress thermique, afin de faire émerger des connaissances nouvelles utiles à l'amélioration des semences dans un contexte agroécologique en plein bouleversement.

Projet LOVE ME
Intégration multi-signaux en 3D des primordia d'ovule pour étudier la fonction des domaines frontières
Coordinateur: Nicolas Arnaud,
Collaboration: Jasmine Burguet, "Modeling and Digital Imaging" MiN team
Autres collaborateurs : Daphné Autran, "Diversité, Adaptation, "'Développement des plantes" DIADE, IRD, Célia Baroux, UZH, Zürich, Suisse, Gabriella Mosca, ZMBP, Université de Tübingen, Allemagne
Résumé
Chez les plantes, les ovules émergent du tissu placentaire dont ils sont séparés par un domaine frontière (BD). Notre projet de recherche vise à comprendre comment la croissance et les propriétés mécaniques des cellules des BD contrôlent la forme et le 'patterning' des ovules.

Projet MOROSCO
Structure moléculaire et rôle du complexe synaptonémal chez Arabidopsis thaliana
Coordinatrice : Mathilde Grelon, équipe "Mécanismes de la Méiose" MeioMe
Collaborateurs : Raphaël Guérois, I2BC, CEA et Owen Davies, University of Edinburgh, GB
Le bon déroulement de la méiose dépend de la formation de crossovers réalisés au sein d’un complexe protéique très conservé, le complexe synaptonémal. Le projet MOROSCO vise à déchiffrer la structure et le rôle de ce complexe chez les plantes en identifiant ses composants et en analysant leurs fonctions à l'aide d'approches complémentaires de génétique moléculaire, de modélisation, de biochimie des protéines et de microscopie à haute résolution.

Projet ORPhagy
Disséquez le rôle du trafic lipidique dans l'autophagie tout au long du développement des plantes et en réponse aux stress
Coordinatrice : Céline Masclaux-Daubresse, équipe "Senescence, Autophagie, Recyclage Nutritionnel et Efficacité d'Utilisation de l'Azote" SATURNE
Collaborateurs IJPB : Fabien Chardon et Anne Marmagne, équipe "Senescence, Autophagie, Recyclage Nutritionnel et Efficacité d'Utilisation de l'Azote" SATURNE
Autres collaborateurs : Amélie Bernard, LBM Bordeaux, CNRS
Résumé
En étudiant la spécificité, l'activité et les fonctions des protéines de transfert de lipides à différentes échelles, nous visons à résoudre leur rôle dans la voie de l'autophagie et la physiologie végétale, abordant ainsi la manière dont les lipides sont mobilisés pour la formation d'autophagosomes, tout au long du développement des plantes et en réponse aux stress.

Projet PlantCPM
Un nouveau formalisme de modélisation pour la morphogenèse des tissus végétaux
Coordinateur : Philippe Andrey, "Modeling and Digital Imaging" MiN team
Résumé
Le développement morphogénétique des organes végétaux est un processus complexe qui résulte de l’intégration combinatoire de processus cellulaires, mécaniques et de signalisation opérant à différentes échelles, des tissus jusqu’au niveau subcellulaire. L’un des défis actuels est de développer des modèles informatiques multi-échelles, en trois dimensions et congruents avec les données expérimentales d’imagerie. Le projet PlantCPM vise à relever ce défi en introduisant un nouveau formalisme dérivé du modèle Cellulaire de Potts et adapté à la modélisation de la morphogenèse des tissus végétaux.  
Un Projet de Recherche Mono-Equipe

Une recherche développée à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal.