Observatoire du Végétal - Biochimie

SAVOIR-FAIRE ET MÉTHODOLOGIES
 
Production de protéines recombinantes pour analyses fonctionnelles et structurales
Protéines étiquetées ou non, dans différents systèmes hétérologues (Escherichia coli, Pichia pastoris, baculovirus-cellules d’insectes)  

Purification

• Chromatographie classique
• Chromatographie d’affinité
• Immunoprécipitation et co-immunoprécipitation  

Isolement et identification de complexes protéiques fonctionnels

• In vivo : Tandem Affinity Purification (TAP-tag) and Biotinylation de proximité BioID)  

Étude des interactions

• In vitro : Micro Scale Thermophorese (MST) 

Approches protéomiques - Partenariat PAPPSO

• Identification
• Études des modifications post traductionnelles et de leur impact (phosphoprotéome, glycoprotéome, oxyprotéome, nitroprotéome ...)
• Protéomique quantitative
• Serveur de calcul pour analyse de grands jeux de données (MS/MS), traitement statistique  

Fractionnement sub-cellulaire  

Biologie structurale

• Dynamic Light Scatering (DLS)
• Robot de cristallisation  

Les activités de l’OV-Biochimie, s’inscrivent dans un continuum avec les activités des autres plateformes de l’OV et bénéficient d’interactions privilégiées avec la Plateforme INRAE d'Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO) et le Synchrotron Soleil-Saclay pour les études structurales.  

L'OV-Biochimie est membre du Réseau INRAE Protéome-Vert qui permet l'échange d'informations et de conseils techniques, et favorise le développement à INRAE des méthodes de spectrométrie de masse dédiées à l’étude du protéome végétal global ou ciblé.