L’OV-Biochimie soutient le développement de projets de biochimie liés à la caractérisation fonctionnelle et structurale des protéines végétales. Ses activités incluent la production de protéines recombinantes, l’étude des modifications post-traductionnelles et l’analyse des interactions protéines-ligands in vitro. Elle offre également des outils de pointe pour la caractérisation des réseaux d’interaction protéiques in planta.
Question biologique
L’OV-Biochimie intervient à deux niveaux. D’une part, elle met à disposition des équipements de pointe pour l’étude des protéines végétales. L’OV-Biochimie occupe 3 pièces et une chambre froide au bâtiment 14 de l’institut, regroupant une douzaine d’appareils analytiques avancés (voir sélection et photos ci-dessous), ainsi que divers consommables, constituant une infrastructure unique à INRAE pour l’analyse des protéines de plantes. L’accès est libre pour les membres de l’IJPB, qui peuvent réserver les appareils et utiliser les consommables nécessaires à leurs expériences.
D’autre part, l’OV-Biochimie propose des services de réalisation d’expériences ou de conseils techniques pour :
> Expression recombinante de protéines végétales : Production de protéines dans des hôtes homologues et hétérologues (E. coli, cellules d’insectes…), sous la responsabilité d’Alexandre de Saint Germain.
> Étude des interactions protéine-ligand : Tests des interactions protéine-protéine et protéine-ligand en solution, détermination des paramètres thermodynamiques par Thermophorèse (MST), Differential scanning fluorométrie (DSF), nanoDSF, fluorescence intrinsèque du tryptophane ou enzymologie (responsable Alexandre de Saint Germain).
> Identification des partenaires protéiques in planta : Identification des partenaires protéiques et ARN de protéines d’intérêt par biotinylation de proximité, TAP, ou co-immunoprécipitation, via expression in planta ou dans la lignée cellulaire d'Arabidopsis PSB-D (Van Leene et al., 2007 ; https://abrc.osu.edu/researchers/cell ; responsable Hakim Mireau).
> Préparation d’échantillons pour la protéomique : Service spécialisé en préparation d’échantillons pour analyses protéomiques, incluant extraction, dosage, purification, séparation et digestion enzymatique des protéines, pour garantir des résultats robustes en spectrométrie de masse (responsable Loïc Rajjou).
Enjeux économiques et sociétaux
Les études menées par l'OV-Biochimie s'intègrent dans de nombreux projets de recherche, contribuant au développement de pratiques agricoles durables et respectueuses de l’environnement, en lien avec les principes de l’agroécologie. À cet effet, l'OV-Biochimie est partenaire de l’Objet Interdisciplinaire (OI) Métabiodivex de l’Université Paris-Saclay et émarge dans plusieurs projets contribuant aux développements de approches agroécologiques : méthode de lutte contre les plantes parasites, identification de composés allélopathiques etc.
L'OV-Biochimie joue également un rôle essentiel dans la formation des étudiants au sein de divers modules d’enseignement (AgroParisTech, UVSQ). Grâce à sa salle de travaux pratiques, elle accueille des groupes d’étudiants pour des formations expérimentales, mettant à leur disposition les équipements de pointe de l'OV-Biochimie. L’OV biochimie a mis en place des travaux pratiques adaptés aux étudiants de Licence afin d’appréhender les techniques d’interactions protéine-ligand. Dans le cadre du programme Des plantes et des Hommes, les membres de l’OV-Biochimie accueillent des groupes de lycéens pour présenter leurs activités et leur métier. Les élèves peuvent ainsi découvrir les équipements de la plateforme et discuter avec les chercheurs.
Équipe et organisation
L’équipe de l'OV-Biochimie comprend deux responsables (Hakim Mireau et Alexandre de Saint Germain), des référents techniques et logistiques (Boris Collet, Loïc Rajjou, et Marianne Azzopardi), ainsi que des référents pour les locaux déportés de l'OV-Biochimie (Thierry Desprez, Marianne Azzopardi, Céline Boulard, Pierre Briozzo, et Anne Marmagne). Ces collaborateurs veillent à la bonne utilisation et au fonctionnement optimal de certains équipements, assurant ainsi une gestion efficace des ressources techniques de l'OV-Biochimie.
L’OV-Biochimie intervient à deux niveaux. D’une part, elle met à disposition des équipements de pointe pour l’étude des protéines végétales. L’OV-Biochimie occupe 3 pièces et une chambre froide au bâtiment 14 de l’institut, regroupant une douzaine d’appareils analytiques avancés (voir sélection et photos ci-dessous), ainsi que divers consommables, constituant une infrastructure unique à INRAE pour l’analyse des protéines de plantes. L’accès est libre pour les membres de l’IJPB, qui peuvent réserver les appareils et utiliser les consommables nécessaires à leurs expériences.
D’autre part, l’OV-Biochimie propose des services de réalisation d’expériences ou de conseils techniques pour :
> Expression recombinante de protéines végétales : Production de protéines dans des hôtes homologues et hétérologues (E. coli, cellules d’insectes…), sous la responsabilité d’Alexandre de Saint Germain.
> Étude des interactions protéine-ligand : Tests des interactions protéine-protéine et protéine-ligand en solution, détermination des paramètres thermodynamiques par Thermophorèse (MST), Differential scanning fluorométrie (DSF), nanoDSF, fluorescence intrinsèque du tryptophane ou enzymologie (responsable Alexandre de Saint Germain).
> Identification des partenaires protéiques in planta : Identification des partenaires protéiques et ARN de protéines d’intérêt par biotinylation de proximité, TAP, ou co-immunoprécipitation, via expression in planta ou dans la lignée cellulaire d'Arabidopsis PSB-D (Van Leene et al., 2007 ; https://abrc.osu.edu/researchers/cell ; responsable Hakim Mireau).
> Préparation d’échantillons pour la protéomique : Service spécialisé en préparation d’échantillons pour analyses protéomiques, incluant extraction, dosage, purification, séparation et digestion enzymatique des protéines, pour garantir des résultats robustes en spectrométrie de masse (responsable Loïc Rajjou).
Enjeux économiques et sociétaux
Les études menées par l'OV-Biochimie s'intègrent dans de nombreux projets de recherche, contribuant au développement de pratiques agricoles durables et respectueuses de l’environnement, en lien avec les principes de l’agroécologie. À cet effet, l'OV-Biochimie est partenaire de l’Objet Interdisciplinaire (OI) Métabiodivex de l’Université Paris-Saclay et émarge dans plusieurs projets contribuant aux développements de approches agroécologiques : méthode de lutte contre les plantes parasites, identification de composés allélopathiques etc.
L'OV-Biochimie joue également un rôle essentiel dans la formation des étudiants au sein de divers modules d’enseignement (AgroParisTech, UVSQ). Grâce à sa salle de travaux pratiques, elle accueille des groupes d’étudiants pour des formations expérimentales, mettant à leur disposition les équipements de pointe de l'OV-Biochimie. L’OV biochimie a mis en place des travaux pratiques adaptés aux étudiants de Licence afin d’appréhender les techniques d’interactions protéine-ligand. Dans le cadre du programme Des plantes et des Hommes, les membres de l’OV-Biochimie accueillent des groupes de lycéens pour présenter leurs activités et leur métier. Les élèves peuvent ainsi découvrir les équipements de la plateforme et discuter avec les chercheurs.
Équipe et organisation
L’équipe de l'OV-Biochimie comprend deux responsables (Hakim Mireau et Alexandre de Saint Germain), des référents techniques et logistiques (Boris Collet, Loïc Rajjou, et Marianne Azzopardi), ainsi que des référents pour les locaux déportés de l'OV-Biochimie (Thierry Desprez, Marianne Azzopardi, Céline Boulard, Pierre Briozzo, et Anne Marmagne). Ces collaborateurs veillent à la bonne utilisation et au fonctionnement optimal de certains équipements, assurant ainsi une gestion efficace des ressources techniques de l'OV-Biochimie.
PHOTOS
Responsable :
Hakim Mireau